2012年8月15日，中华网报道了《合生元金装奶粉存虫子和异物吃坏孩子肠胃》。报道显示，网友“现在的生活是飘啊飘的”近日在微博上投诉， “我的小孩9个月了，一直吃合生元超级金装奶粉，最近有买了一个2阶段的，奶粉较以前的发白，溶解较差，小孩吃了之后一天拉三四次肚子，请生元公司给予合说明。”
对此，合生元官方微博给网友回复称，“每个品牌奶粉的生产过程和条件或添加的成分都不尽相同，甚至同一品牌冬季及夏季泌乳在味道及颜色上都有些许的差异这些都是让奶粉质地看起来不一样的原因。宝宝大便次数增多可能因素较多。”
2012年8月8日，亲贝网发表了《合生元二段内发现有虫子奶粉安全遭网友质疑》。近日，一位名为“不喜欢忽悠的人”的网友在微博上称，“合生元奶粉2段一打开居然有个小虫子”。并且，还对国内奶粉的安全提出质疑，称“现在的宝宝到底还能吃什么奶粉”。
据亲贝网统计，这已是合生元近期内第三次被曝出质量问题了。此前，还有消费者投诉称，在合生元奶粉中发现了类似蟑螂屎的异物和白色的硬物。
2012年8月1日，中国日报网报道了《合生元二段奶粉吃出异物其洋身份遭网友质疑》。报道显示，近日，网友“Lucas逸洋”在微博上称， “在合生元超级金装第二段奶粉中发现了一块东西，好像是结片的奶，很硬。
有点担心这奶粉的质量了?大家有发现过这样的问题吗?”对此，有网友回复称，“假洋牌子的奶粉，别害娃，换了吧。法国证实合生元没有在法国注册的，有一朋友还在奶粉里面发现过虫子。”
面对网友的质疑，合生元的官方微博回应称，“合生元奶粉系列均为欧洲原装进口，每批产品均具原产地证明和出入境检验检疫卫生证书，保证产品质量和来源。”并且，建议当事网友私信提供联系方式，表示会有专人跟其联系。
2012年6月20日，中国网络电视台报道了《合生元奶粉现不明胶状物体厂家：那是蛋白质》。报道显示，两个星期前，彭先生在乐清市翁扬接到购买了一盒合生元金装妈妈配方奶粉，回家冲泡的时候在杯子里发现一团一元硬币大小的胶状物体，彭先生告诉记者：“泡开了以后特别恶心，向鼻涕一样，这团东西风干以后就变成两颗硬硬的东西，颜色和奶粉差不多，混在奶粉里真不容易察觉。”
事后彭先生联系了合生元厂家，“厂家说奶粉完全没有质量问题，出现胶状是因为蛋白质在运输途中发生变化，专业术语我也没听明白。”彭先生表示对厂家的敷衍解释非常不满。
随后记者拨打了合生元的官方电话反映了彭先生的情况，一位自称是公共事务部的冯小姐表示要先和消费者取得联系看到照片才能做出回应，“合生元是一个负责任的企业，我们会马上联系消费者尽快处理好此事的。”但是事情过去了多天，彭先生告诉记者合生元方面联系他拿走照片以后再无回应。
2012年6月5日，青岛新闻网发表了《合生元奶粉中现菜叶网友称曾喝出过金属》。文章显示，2012年3月3日，李女士称自己在台东利群超市购买了多桶合生元超级金装较大婴儿奶粉及儿童益生菌，奶粉每桶价值300多元，消费总计2000多元。
