4、染色体的问题
染色体异常包括数量和结构异常，数量上的异常可分为非整倍体和多倍体，最常见的异常核型为三倍体，而16三体又占1/3，常有致死性。
关于染色体问题目前的研究认为染色体间配对、互换和分离形成配子，配子结合形成合子。如果其中的合子有异常的，则导致不能正常发育，可导致流产、死胎、死产、畸形儿。
5、生殖道感染
妊娠早期严重的生殖道感染可引起胚胎死亡或流产，较轻感染亦可引起胚胎畸形。近年来研究表明，支原体感染与胚胎停止发育有关，胚胎停止发育妇女宫颈分泌物支原体感染阳性率明显高于正常妇女，并有极显著差异。
6、环境因素
环境类因素可直接作用于中枢神经内分泌调节系统，引起生殖激素分泌紊乱，出现生殖率下降和胚胎发育异常。其中包括X射线、微波、噪音、超声、高温等物理因素，以及重金属铝、铅、汞、锌影响受精卵着床或直接损害胚胎而导致流产。以及不良生活习惯如吸烟、酗酒、咖啡、毒品、某些药物等均影响早期胚胎发育。
注意：
一旦发生胚胎停育，应该查找病因，不能明确诊断，治疗上就无从下手。很难避免再次发生胚胎停育的问题。
需要检查的项目有：
生殖激素六项、优生优育五项、抗精子抗体、抗心磷脂抗体、抗绒毛膜促性腺激素抗体、沙眼衣原体、精子质量、卵子发育、染色体等。
男性的检查项目有：一般男科检查，精子分析、生殖激素六项、免疫抗体、染色体等待。
在没有确定病因之前，不宜再次怀孕，以免导致再次胚胎停育。
