患多囊卵巢综合征的妇女对减肥或服用氯米芬治疗没有不良反应的话，可以选择其他方法进一步治疗：试管受精，促性腺激素药物(有可能导致多胞胎)，或外科手术来进行调整。生育药物问世以前，一般采用外科手术清除卵巢组织的楔形物重新恢复排卵。但因为它常常会引起卵巢和输卵管之间的粘连，大家对手术持否定态度。目前，使用腹腔镜和激光束或电烙术穿透卵巢表面，破坏大部分产生睾丸激素的卵巢组织。腹腔镜手术在门诊完成，大约需要35分钟的时间，1～2天的恢复期。它要求全身麻醉。
对卵巢组织进行破坏，可以在8～12个月内抑制卵巢分泌过量睾丸激素，并引发排卵。患者手术后，足月怀孕率占50%～60%。当卵巢组织恢复到原来的状态时，会再次出现多囊卵巢。长期并发症并不多见，但卵巢组织有可能会结瘢以及发生粘连。对那些不愿忍受药物不良反应和对体外受精不感兴趣的妇女来说，外科疗法不失为一个选择。
