(1)处女膜闭：在胚胎发育中，因尿生殖窦的阴道芽状突起未能被贯通所致。发身期后致生殖道经血潴留。原发性假性闭经，发身期后，出现周期性下腹痛，婚后不能性交。检查可见处女膜无孔，局部饱满膨出；肛腹双合诊发现，有直肠前囊性包块感；B超或CT扫描等影像学检查，可呈现阴道宫腔积液图像。在处女膜最薄处穿刺，可抽出咖啡色血性液。
(2)阴道横膈：可能因两侧副中肾管尾端与尿生殖窦相接处未被贯通所致。阴道横膈多位于阴道中1/3交界处，也有在其他部位者。完全性横膈少见，可致阴道闭锁；通常在膈中央或侧方有小孔，其大小不一，影响阴道液与经血排放。不孕患者可能经血排放不畅致淋漓不净，痛经、经血潴留可能合并感染，性交痛、性生活不满意。
(3)阴道纵隔与双阴道：因两侧副中肾管会合后，中膈部分消失则形成不完全纵隔；中膈未消失则致完全纵隔形成双阴道。同时合并双子宫畸形。阴道纵隔常合并子宫畸形，可能不孕；一般对性生活、妊娠影响不大。
(4)先天性无阴道：在胚胎期约7～10周性器官分化形成中，两侧副中肾管会合后，其尾端发育受阻或停滞未能向下发展，而致先天性无阴道，常合并先天性无子宫或子宫畸形，偶有正常发育的子宫。卵巢来源于生殖嵴，很少同时受累，通常发育与功能正常。先天性无阴道的临床表现是：原发性闭经，亦有周期性下腹痛者，婚后不能性交等。检查女性外阴正常，处女膜内仅有浅窝无阴道；无子宫或子宫畸形，可能合并泌尿系统或骨骼畸形。卵巢功能测定属正常范围。
(5)阴道狭窄与粘连：先天性阴道狭窄，如阴道横膈、纵隔等。继发性阴道狭窄与粘连。
