首先，人体内分泌系统能够分泌微量化学物质-激素通过血液循环到细胞和神经系统一起调节与相应的受体相结合，影响代谢过程而发挥其广泛的全身性作用，会影响人的新陈代谢和生理功能。正常情况下，各种激素的分泌是平衡的，一旦由于某种原因而引起激素分泌不平衡，就会导致内分泌失调，出现一些病症。
而内分泌不孕，是指女性因内分泌失调与情绪因素出现女性下丘脑垂体-卵巢性腺轴激素分泌过多或过少，导致新陈代谢功能紊乱，以至于出现排卵障碍、闭经、多囊卵巢综合征、多毛症与男性化、高催乳素血症、黄体功能不全、功能性子宫出血、排卵期出血、低脂血症，（脂肪总量低于体重的6%）卵巢功能不全、卵巢早衰等疾病，从而引发的不孕。
简单来说，内分泌因素导致的不孕实际上就是下丘脑垂体卵巢的功能障碍或者说功能缺失，我们都知道正常的排卵是在卵巢里面排卵的，但是卵巢的排卵是受到下丘脑和垂体的控制的，如果我们的下丘脑、垂体、卵巢三个方面中的任何方面发生问题都会导致排卵异常。
在不孕检查方面，一般是月经期的第3天测性激素六项等，一般检查不需要空腹，不过有时会建议患者休息半小时再进行检查。如果要了解各项激素的基础状态，需要月经第2-4天抽血（见月经血为第一天）；检测黄体功能，可在月经第22-24天抽血查孕酮。35岁以下，月经周期规则的备孕女性不一定要检查；如果超过35岁，月经不正常，黄体功能不全，有多囊卵巢综合征等的建议检查一下为好。然后通过性激素六项的检查就可以确定各项激素的基础水平来鉴别问题。
如果说，下丘脑、垂体、卵巢本身功能都是正常的，但是三者之间的调节出了问题最终也会导致不排卵。如果出现这种情况，用一些诱导排卵的治疗是完全可以治疗的。还有一些情况，例如卵巢出现问题（卵巢手术、化疗、先天性发育不良、卵巢功能丧失、卵巢里面没有卵泡等情况）就叫卵巢性的无排卵或者叫卵巢性的闭经，无论如何治疗病人都是不会怀孕的，要做的就是补充一些激素（雌激素、孕激素）来维持女性的健康。
下丘脑或者是垂体出了问题（下丘脑、垂体不能分泌刺激卵泡发育的一些激素，比如促卵泡生成素或者是促黄体生成素），但是卵巢里面还是有很多卵泡的情况下，使用一些促性腺激
素一类的药物（比如说促卵泡生成素或者用促黄体生成素等外源性的药物）就可以刺激卵泡的发育。唯一不能怀孕的就是卵巢性的闭经或者是卵巢性的无排卵，无论用什么药物，卵巢里面没有卵泡是不可能怀孕的。
